水稻壮秧剂只能“垫底”。正确的做法是在水稻旱育秧秧床整好后，将壮秧剂与过筛肥土拌匀，均匀地撒入旱育秧秧床，随后将秧床浇足墒，待明水下渗后播种，播后用“纯净”（不含壮秧剂）的肥土将谷种盖严即可。

水稻壮秧剂中含有调酸剂、消毒剂与多种秧苗生长所需要的肥料，水稻旱育秧使用壮秧剂，目的是对苗床土壤进调酸、消毒、培肥。如果用水稻壮秧剂拌肥土盖籽，由于盖籽土较干，很容易因调酸剂、肥料等浓度过高导致烂芽、烧苗，农户在使用时应特别注意。